Uses of Class
jprotein.data.datatype.Atom

Packages that use Atom
jprotein.data.datatype   
 

Uses of Atom in jprotein.data.datatype
 

Methods in jprotein.data.datatype that return Atom
 Atom Residue3D.getSideChainAtom(int i)
           
 Atom Residue3D.getSqueletonAtom(int i)
          Accesseurs d'atomes (dans la chaine laterale et le squelette
 Atom Residue3D.getSqueletonAtom(java.lang.String atomName)
           
 

Methods in jprotein.data.datatype with parameters of type Atom
 float Atom1.distance(Atom atom)
           
 float Atom.distance(Atom atom)
          Méthodes pour le calcul de la distance entre deux atomes.
 void Atom1.setAccessibility(Atom atom)
           
 void Atom.setAccessibility(Atom atom)
          Méthode pour calculer les points accessibles de l'atome courant par un atome par défaut (oxygène) sachant que l'espace est aussi encombré par l'atome atom.
 void Atom1.setAccessibility(Atom atom, float probeRadius)
           
 void Atom.setAccessibility(Atom atom, float probeRadius)
          Méthode pour calculer les points accessibles de l'atome courant par un atome sonde de rayon probeRadius sachant que l'espace est aussi encombré par l'atome atom.
 void Atom1.setAccessibility(Atom atom, float probeRadius, float noise)
           
 void Atom.setAccessibility(Atom atom, float probeRadius, float noise)
          Méthode pour calculer les points accessibles de l'atome courant par un atome sonde de rayon probeRadius sachant que l'espace est aussi encombré par l'atome atom en spécifiant un bruit (?).