Cours M2 - Specialité BIM, Master d'Informatique - UPMC

Supports de cours - vague 1

A.Carbone - PHYL	Maximum Likelihood	octobre 2009
A.Carbone - PHYL	Algorithmes de reconstruction d'arbres phylogénétiques	octobre 2009
S.Holmes - PHYL	Notes de cours et documents variés	oct-nov 2009

S.Holmes - SCLASS	Notes de cours et documents variés	oct-nov 2009
P-H. Wuillemin - SCLASS	Notes de cours	sept-nov 2009

G.Fischer - EVOL	Introduction à la génétique et à la génomique	22 septembre 2009
C.Thermes - EVOL	Les différents niveaux d'information codés dans les génomes	29 septembre 2009
I. Lafontaine - EVOL	Comparaison de séquences et notion d'homologie	6 octobre 2009
G.Fischer - EVOL	Anatomie et annotations des génomes	13 octobre 2009
A.Carbone - EVOL	Codon bias in bacteria and its implications	20 octobre 2009
G.Fischer - EVOL	Les réarrangements chromosomiques et la notion de synténie	27 octobre 2009
B.Dujon - EVOL	L'évolution des génomes	3 novembre 2009

Supports de cours - vague 2

B.Dujon - GCOMP	Dynamique des génomes - éléments mobiles - transposons	24 novembre 2009
A.Carbone - GCOMP	Alignement par paires - algorithmes exactes & construction de matrices de substitution	30 novembre 2009
A.Carbone -GCOMP	Alignement par paires - algorithmes heuristiques & Alignement multiple	7 decembre 2009
B.Dujon -GCOMP	Génie biologique	14 decembre 2009

H.Isambert - GRES
H.Isambert -GRES

D.Gilis - STRUCT

Modalités d'examen PHYL
Responsable: A.Carbone

Examen écrit - Lundi 16/11/09, 9h-11h Salle 203 (55-65)
Documents pas authorisés à l'écrit.
Pour l'évaluation sur la partie de Susan Holmes, faire référence ici .
La note finale incluera l'évaluation de la partie de Susan Holmes, la note d'examen écrit et l'évaluation des TP de Linda Dib.

Modalités d'examen EVOL
Responsable: G.Fischer

Examen ecrit - Mardi 17/11/09, 13:30h-15:30h Salle 425 Atrium
Documents pas authorisés.
La note finale incluera la note d'examen écrit et l'évaluation du TP de Guénola Drillon.

Modalités d'examen SCLASS
Responsable: PH.Wuillemin

Examen ecrit - Lundi 16/11/09, 13:30h-15:30h Salle 313 Bât. 41
Documents authorisés.
Controler ici pour plus d'information.
La note finale sera detérminée par la seule note d'examen ecrit.

Articles a télécharger:

A.Carbone, M.Gromov, Mathematical Slices of Molecular Biology, La Gazette des Mathématiciens, Numéro spécial 88:11-80, Société Mathématique de France, 2001.