K aaa 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 K aag 0.89146984 0.886191 0.8701719 0.8620522 0.80241495 0.795082 0.6025641 0.60256416 0.58227855 0.5243902 0.47663552 0.48598132 0.42056075 0.43362832 0.43362832 0.43362832 N aac 0.8001277 0.8389 0.8932519 0.9533292 1.0 0.9522059 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 N aat 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.8809524 0.80851066 0.7083333 0.7659574 0.7142857 0.5657895 0.43298972 0.41509432 0.41509432 0.41509432 T aca 0.35766533 0.2774649 0.23023716 0.21461843 0.19001752 0.16519824 0.14893617 0.12658228 0.10465117 0.121951215 0.097087376 0.09482759 0.08196721 0.06716418 0.06716418 0.06716418 T acc 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 T acg 0.504013 0.44960916 0.4160079 0.3912576 0.3502627 0.2907489 0.17021276 0.20253165 0.18604651 0.18292682 0.2038835 0.18965518 0.18852459 0.17910448 0.17910448 0.17910448 T act 0.3015341 0.23031017 0.1987813 0.18165532 0.16462347 0.14537445 0.21276595 0.26582277 0.23255815 0.24390243 0.2038835 0.18103449 0.19672132 0.19402985 0.19402985 0.19402985 R aga 0.061096214 0.019161422 0.010361979 0.007649309 0.0036603222 0.0019193859 0.0 0.014084507 0.014492753 0.014925373 0.012987014 0.012048193 0.011764707 0.011235954 0.011235954 0.011235954 R agg 0.09353435 0.0500601 0.030809617 0.022947924 0.015373353 0.01919386 0.012820512 0.014084507 0.0 0.014925373 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 R cga 0.206892 0.14282684 0.108179055 0.08296558 0.068814054 0.044145875 0.025641024 0.014084507 0.014492753 0.014925373 0.012987014 0.012048193 0.011764707 0.011235954 0.011235954 0.011235954 R cgc 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 R cgg 0.5351413 0.48016688 0.45316386 0.439541 0.40922403 0.33397314 0.25641024 0.32394364 0.3623188 0.37313432 0.36363637 0.37349397 0.37647063 0.37078655 0.37078655 0.37078655 R cgt 0.3593688 0.30884537 0.2836419 0.2830244 0.28623718 0.28406912 0.47435895 0.53521127 0.5652174 0.5373134 0.5844156 0.5903614 0.64705884 0.6179775 0.6179775 0.6179775 S agc 0.87716264 0.9256406 0.9546328 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 S agt 1.0 1.0 1.0 0.9563025 0.86746985 0.86567163 0.6216216 0.6969697 0.6388889 0.64705884 0.55263156 0.3469388 0.27118644 0.26153848 0.26153848 0.26153848 S tca 0.3480392 0.28184915 0.25951558 0.24537815 0.2128514 0.14925373 0.13513513 0.15151514 0.13888888 0.11764706 0.10526316 0.08163266 0.05084746 0.030769229 0.030769229 0.030769229 S tcc 0.7729719 0.8272711 0.89504033 0.95882356 0.9096386 0.8308457 0.70270276 0.93939394 0.9166666 0.9117647 0.9736842 0.8571429 0.7457627 0.67692304 0.67692304 0.67692304 S tcg 0.42156863 0.39974916 0.40638217 0.3957983 0.35341367 0.2935323 0.16216217 0.12121212 0.111111104 0.11764706 0.13157894 0.12244899 0.10169492 0.15384616 0.15384616 0.15384616 S tct 0.43377548 0.35728365 0.3502499 0.33277312 0.31526104 0.32338306 0.5135135 0.60606056 0.6666667 0.6764706 0.6842105 0.71428573 0.7288136 0.6615384 0.6615384 0.6615384 I ata 0.04506572 0.018510876 0.009760632 0.005369471 0.0024752475 0.001650165 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 I atc 0.44864038 0.40417376 0.3948408 0.39631808 0.40037125 0.3877888 0.24409449 0.34545457 0.43269232 0.4423077 0.48760334 0.6349206 0.7906977 0.8188406 0.8188406 0.8188406 I att 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 M atg 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 Q caa 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 Q cag 0.8328625 0.8200143 0.7785235 0.73390424 0.71158594 0.67368424 0.5531915 0.50574714 0.4520548 0.4512195 0.3783784 0.34177214 0.29885057 0.22826086 0.22826086 0.22826086 H cac 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 H cat 0.85649204 0.78470004 0.7212312 0.63751864 0.5747331 0.53475934 0.6363637 0.5882353 0.5882353 0.5714286 0.5555555 0.3448276 0.23076923 0.17307691 0.17307691 0.17307691 P cca 0.31776947 0.24517205 0.21317129 0.18571427 0.1651206 0.15136476 0.06944444 0.04225352 0.041666668 0.030303031 0.04 0.023255814 0.021978023 0.02970297 0.02970297 0.02970297 P ccc 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 P ccg 0.3708155 0.33624732 0.31926423 0.314652 0.30426717 0.2605459 0.18055557 0.12676057 0.125 0.10606061 0.13333333 0.12790698 0.12087913 0.10891089 0.10891089 0.10891089 P cct 0.37155226 0.29889533 0.26786008 0.26666665 0.2560297 0.23325062 0.19444445 0.1971831 0.19444445 0.21212122 0.21333334 0.23255813 0.28571427 0.28712872 0.28712872 0.28712872 L cta 0.344989 0.29737407 0.27570897 0.25938782 0.24720892 0.21923938 0.22972973 0.19402985 0.203125 0.18181819 0.16883117 0.1707317 0.15909092 0.14444444 0.14444444 0.14444444 L ctc 0.8217039 0.8485415 0.8491836 0.8759861 0.92185 0.9865772 0.972973 0.9104478 0.921875 0.92424244 0.8311689 0.8780488 0.89772725 0.9333333 0.9333333 0.9333333 L ctg 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 L ctt 0.44874924 0.39541328 0.36350614 0.33322814 0.32535884 0.30201343 0.27027026 0.2835821 0.265625 0.24242425 0.23376624 0.2317073 0.22727273 0.2111111 0.2111111 0.2111111 L tta 0.2888216 0.23383912 0.19951303 0.16251183 0.13397129 0.12751679 0.054054055 0.07462687 0.09375001 0.09090909 0.077922076 0.08536585 0.09090909 0.08888888 0.08888888 0.08888888 L ttg 0.7531467 0.6852352 0.63993126 0.5992426 0.56459326 0.5279642 0.4864865 0.5522388 0.60937506 0.5757576 0.5844156 0.65853655 0.6931818 0.74444443 0.74444443 0.74444443 E gaa 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 E gag 0.8687355 0.83210987 0.8120581 0.7817031 0.7353309 0.6764253 0.3515625 0.30232558 0.3125 0.31496063 0.37179488 0.39877298 0.4345238 0.42285714 0.42285714 0.42285714 D gac 0.43666252 0.41504753 0.43020907 0.4499425 0.50797266 0.4891089 0.4395604 0.4642857 0.5189874 0.5625 0.62921345 0.6451613 0.6304348 0.6736842 0.6736842 0.6736842 D gat 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 A gca 0.3848437 0.30274466 0.26549798 0.24102344 0.21943232 0.20087977 0.20610689 0.18571429 0.18666665 0.20289855 0.15384614 0.14973262 0.1443299 0.14553991 0.14553991 0.14553991 A gcc 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 A gcg 0.42486486 0.36955458 0.34580356 0.33519673 0.32041484 0.28152493 0.20610689 0.15714286 0.14666666 0.1594203 0.21301776 0.21390373 0.23195878 0.22065727 0.22065727 0.22065727 A gct 0.41005522 0.3406427 0.31319165 0.29262525 0.2838428 0.31231672 0.3129771 0.32142857 0.3333333 0.33333334 0.4142012 0.43315506 0.5 0.50234747 0.50234747 0.50234747 G gga 0.33120373 0.25272068 0.21734986 0.17612456 0.13469736 0.10204081 0.064516135 0.06593406 0.07446808 0.07777777 0.068627454 0.0625 0.05263158 0.047244094 0.047244094 0.047244094 G ggc 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.90551186 0.90551186 0.90551186 G ggg 0.715793 0.64377266 0.58293617 0.52041525 0.44501278 0.41950113 0.2903226 0.25274727 0.23404256 0.21111111 0.2254902 0.24107143 0.2368421 0.24409449 0.24409449 0.24409449 G ggt 0.6319152 0.5743652 0.558945 0.55916953 0.5720375 0.57369614 0.53763443 0.5714286 0.5744681 0.6111111 0.7647059 0.8482143 0.9824562 1.0 1.0 1.0 V gta 0.1832118 0.14186637 0.12628509 0.11032358 0.091114454 0.08190476 0.029702973 0.00990099 0.0 0.01 0.00877193 0.016 0.021897811 0.0397351 0.0397351 0.0397351 V gtc 0.5428527 0.53313196 0.5322312 0.55778116 0.5549699 0.5847619 0.5841584 0.5445544 0.56565654 0.57 0.5877193 0.56 0.51094896 0.48344374 0.48344374 0.48344374 V gtg 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 V gtt 0.4253509 0.36874273 0.35259795 0.33682588 0.34036145 0.3504762 0.2970297 0.2673267 0.26262626 0.25 0.30701756 0.296 0.2992701 0.2781457 0.2781457 0.2781457 Y tac 0.8797823 0.93879044 0.99765193 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 Y tat 1.0 1.0 1.0 0.9541004 0.84109586 0.7859922 0.50980395 0.4 0.37288138 0.375 0.36065575 0.33333334 0.2962963 0.29545456 0.29545456 0.29545456 C tgc 0.933817 0.9775413 0.9966666 1.0 0.9145299 0.85365856 0.9375 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 C tgt 1.0 1.0 1.0 0.9625468 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 0.93333334 0.8235294 0.7142857 0.44 0.4285714 0.4285714 0.4285714 W tgg 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 F ttc 0.36386794 0.33523586 0.33688855 0.37059295 0.39079332 0.36147758 0.35000002 0.369863 0.35135135 0.3768116 0.39726028 0.56790125 0.8271605 0.948052 0.948052 0.948052 F ttt 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0 1.0