| L1_ASB_Introduction.pdf | Introduction | 30 novembre 2007 |
| L2_ASB_alignement.pdf + L2_FASTA.pdf | Alignement par paires | 7 decembre 2007 |
| L3_ASB_Alignement_Structures.pdf | Algorithmes d'alignement de structures de proteines (cours assuré par M.Carpentier) | 14 decembre 2007 |
|
L4_ASB_alignement_heuristiques_et_multiple |
Alignement par paires et alignement multiple | 21 decembre 2007 |
| L5_ASB_recherche_motifs_algo_exactes.pdf | Algorithmes de recherche de motifs exactes, CONSENSUS et PatternBranching | 11 janvier 2008 |
| L6_ASB_1_recherche_motifs_algo_prob L6_ASB_2_algorithmes_ARN |
a. Algorithmes probabilistes
de recherche de motifs: Gibbs sampling, projections aleatoires, EM. b. Detection des structures secondaires d'ARN et dynamique de repliement. (seminaire de Stefan Engelen) |
18 janvier 2008 |
|
L7_ASB_stat_promoteures_et_detection_des_genes |
a. Algorithmes pour la recherche
des genes: GENSCAN, Exon Chaining, Spliced Alignment, EXOGEAN |
25 janvier 2008 |
8:30h-9:30h:
examen ecrit - Il s'agira de questions de cours. Preuve sans documents.
10:00-13:00h: soutenances orales de 15 min: presentation d'un article ou du
projet.
Présence de tous à toutes les soutenances orales (si compatible
avec vos horaires de cours).
Liste de sujets/articles. Articles proposés en 2007-08. Un rapport écrit est demandé de 3-4 pages ou résultats obtenus et méthodologies employées sont discutées. Les méthodes doivent etre expliquées et justifiées dans leurs integrité, et des possibles alternatives, si envisageables, doivent etre indiquées.
Exam
2006-07-1 et Exam
2006-07-2
A.Carbone, M.Gromov, Mathematical Slices of Molecular Biology, La Gazette des Mathematiciens, Numéro spécial 88:11-80, Société Mathématique de France, 2001.